A múltját vesztett Treadstone-veterán újabb ügybe keveredik, melynek felgöngyölítése során bebizonyosodik, a képességei korántsem koptak meg a kiképzése óta eltelt idő alatt, annak ellenére, hogy már otthagyta a szervezetet.

Miután egy tömeglövöldözésben életét vesztette a nő, akit szeretett, Jason Bourne rájön, hogy a halála nem pusztán az, aminek látszik. Még rosszabb, hogy gyanúja szerint az a Treadstone-ügynök állhat mögötte, aki azzá tette, ami, akivel szoros kapcsolatot ápolt.

Aztán lelőnek egy kongresszusi képviselőt New Yorkban. A gyilkossághoz köze lehet annak a törvényjavaslatnak, amely szigorúbban szabályozná az adatok kezelésével kapcsolatos eljárásokat a technológiai szektorban, tehát techóriások és a Medúza nevű titkos szervezet is érintett lehet. Bourne szaglászni kezd, és hamarosan rájön, hogy egyedül van, sőt talán rá vadászik még egykori ügynöksége is. Csak a kíváncsi újságíró, Abbey Laurent segítségére támaszkodhat, aki, meglepetésére, érzelmeket ébreszt benne.